O primeiro E-99 modernizado da Força Aérea Brasileira deve ficar pronto no primeiro semestre de 2020. A modernização das cinco unidades, realizada pela Embraer, deve ser concluída em 2022.
Tendo entrado em operação em 2002, a frota de E-99 já demanda melhorias dos sistemas de guerra eletrônica, sistemas de comando e controle, sistemas de contramedidas eletrônicas e do próprio radar de vigilância aérea, que terá seu alcance ampliado. A antena será a mesma, porém a capacidade de processamento de dados será ampliada.
A previsão inicial era ter aeronaves modernizadas em 2014, porém o programa passou por atrasos.
As cinco aeronaves operam a partir do Esquadrão Guardião, parte da Ala 2, em Anápolis (GO).
